Не каждая квартира с капиталом в истории опасна. Больше того, таких квартир на вторичном рынке очень много, и отказываться от всех подряд означает выбросить половину предложений. Опасны конкретные сочетания.
Отказываться стоит, когда продавец не дает справку из СФР или договор целиком. Когда доли детям не выделены, а продавец предлагает решить это после сделки. Когда разрешение опеки есть, а подтверждения, что его условие исполнено, нет и взять его неоткуда. Когда сделка спешная, цена заметно ниже рынка, а объяснение цены звучит туманно.
Во всех остальных случаях вопрос решается документами. Их надо получить и прочитать до того, как деньги ушли.
Если разбираетесь со своей конкретной ситуацией, напишите мне в мессенджер. Посмотрю документы по вашему объекту и скажу, есть ли там реальный риск или тревога напрасная.